Относится к строениям Генуэзской крепости Каффа (район Карантин) в Феодосии. Сооружён в ХIV–ХV веках. Храм является армянским культовым строением и создан в духе аналогичных церквей на территории Армении и Крыма. Церковь Иоанна Богослова не отличается значительным количеством декоративных элементов — они сохранились лишь над дверью внутреннего дворика (орнамент, кресты).