Церковь построена в 12 веке на месте древней византийской базилики. По преданию, к одной из колонн, стоящей рядом с храмом, был привязан и нещадно бит плетьми апостол Павел, не успевший к тому времени ещё обратить в христианскую веру римского проконсула Сергия Павла. До нашего времени от колонны Святого Павла дошла лишь её мраморная база