Церковь Боголюбской Божьей матери была построена в Высоко-Петровском монастыре в 1684-85 гг. на месте более раннего храма Покрова. В 1682 г. в храме Покрова были похоронены Иван и Афанасий Нарышкины, братья царицы Натальи Кирилловны, убитые во время стрелецкого бунта. В 1684-85 гг. престол церкви Покрова перенесли в церковь над Святыми воротами, а на месте храма Покрова была построена церковь Боголюбской Божьей матери (некоторые источники утверждают, что Петр I привез в Москву чудотворную икону, и храм был построен для нее). Храм представлял собой двусветный бесстолпный четверик; был пятиглавым, c кокошниками в завершении, с тремя апсидами и пониженной трапезной. Храм с трех сторон обходила низкая открытая галерея. В декоре фасадов преобладают традиционные элементы "узорочья": спаренные колонки, многопрофильный карниз, килевидные кокошники. Барабаны украшены аркатурно- колончатым поясом. В монастыре провел последние годы жизни отец царицы Кирилл Полуэктович Нарышкин, принявший постриг. Он был похоронен у юго-западного угла Боголюбской церкви. Над его могилой была поставлена часовня: небольшое каменное здание, перекрытое коробовым сводом и увенчанное главкой. В холодном храме Боголюбской Богоматери до 1771 г. (во время чумы 1771 г. было запрещено хоронить при московских храмах) погребались все члены фамилии Нарышкиных. В 1805 г. Боголюбская церковь была перестроена. Часть галереи, которая ранее обходила храм, застроили при увеличении трапезной. В 1812 г. была разграблена усыпальница Нарышкиных (иконы и парадные покровы), были вскрыты гробницы в поисках золота; исчезли из ризницы бархатные, обшитые серебром покровы. В 1920-е гг. монастырь закрыли и передали гражданским учреждениям. Часть помещений отдали под жилье. Из-за использования монастырских зданий не по назначению, из-за установки печей и водопровода в помещениях, не рассчитанных на это, монастырь начал разрушаться и к 1990 г. был в запущенном состоянии. После 1990 г. монастырские здания были поставлены на реставрацию. Восстанавливается первоначальное завершение Боголюбской церкви.